Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms