Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPAP53621 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPAP53621 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPAP53621 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPAP53621 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPAP53621 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPAP53621 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPAP53621 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPAP53621 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPAP53621 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPAP53621 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPAP53621 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPAP53621 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPAP53621 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COPAP53621 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COPAP53621 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COPAP53621 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COPAP53621 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPAP53621 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPAP53621 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPAP53621 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms