Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DAP3P51398 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DAP3P51398 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms