Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRB2P47870 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRB2P47870 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRB2P47870 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRB2P47870 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRB2P47870 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms