Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPZBP47756 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms