Protein–RNA interactions for Protein: P46019

PHKA2, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, liver isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA2P46019 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHKA2P46019 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHKA2P46019 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHKA2P46019 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHKA2P46019 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHKA2P46019 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHKA2P46019 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHKA2P46019 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PHKA2P46019 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHKA2P46019 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHKA2P46019 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHKA2P46019 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHKA2P46019 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHKA2P46019 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHKA2P46019 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHKA2P46019 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHKA2P46019 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms