Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSFMP43897 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TSFMP43897 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSFMP43897 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSFMP43897 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms