Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSKP43235 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSKP43235 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSKP43235 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSKP43235 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSKP43235 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSKP43235 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSKP43235 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSKP43235 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSKP43235 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSKP43235 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSKP43235 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSKP43235 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSKP43235 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSKP43235 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSKP43235 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSKP43235 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSKP43235 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSKP43235 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSKP43235 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSKP43235 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSKP43235 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSKP43235 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSKP43235 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSKP43235 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSKP43235 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms