Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECI1P42126 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECI1P42126 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms