Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms