Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms