Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJC1P36383 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJC1P36383 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJC1P36383 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJC1P36383 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms