Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms