Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN7P35236 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms