Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms