Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD1P28340 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD1P28340 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD1P28340 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD1P28340 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms