Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms