Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B4P23634 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B4P23634 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms