Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms