Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms