Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCP1P17987 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCP1P17987 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TCP1P17987 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCP1P17987 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCP1P17987 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCP1P17987 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCP1P17987 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCP1P17987 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TCP1P17987 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCP1P17987 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCP1P17987 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCP1P17987 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms