Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms