Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTLA4P16410 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms