Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD46P15529 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD46P15529 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD46P15529 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD46P15529 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms