Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1P11387 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1P11387 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1P11387 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms