Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD28P10747 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD28P10747 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms