Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms