Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC192P0DO97 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms