Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms