Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms