Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP10P09238 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP10P09238 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP10P09238 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP10P09238 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP10P09238 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP10P09238 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP10P09238 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP10P09238 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP10P09238 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP10P09238 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP10P09238 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP10P09238 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP10P09238 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP10P09238 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP10P09238 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP10P09238 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP10P09238 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP10P09238 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP10P09238 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP10P09238 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP10P09238 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP10P09238 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP10P09238 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP10P09238 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms