Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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