Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NGFRP08138 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NGFRP08138 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NGFRP08138 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NGFRP08138 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NGFRP08138 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NGFRP08138 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NGFRP08138 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NGFRP08138 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms