Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOA1P02647 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOA1P02647 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOA1P02647 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms