Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms