Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms