Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-HP01893 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms