Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNTO95613 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNTO95613 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNTO95613 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNTO95613 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNTO95613 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNTO95613 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNTO95613 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNTO95613 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNTO95613 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNTO95613 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNTO95613 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNTO95613 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCNTO95613 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCNTO95613 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PCNTO95613 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCNTO95613 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNTO95613 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNTO95613 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNTO95613 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNTO95613 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNTO95613 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNTO95613 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNTO95613 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNTO95613 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNTO95613 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNTO95613 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNTO95613 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNTO95613 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms