Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms