Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX4O95219 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNX4O95219 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX4O95219 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX4O95219 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX4O95219 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX4O95219 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX4O95219 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX4O95219 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX4O95219 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms