Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms