Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL5O76039 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL5O76039 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms