Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLOT1O75955 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms