Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms