Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPLO60437 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPLO60437 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PPLO60437 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PPLO60437 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PPLO60437 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPLO60437 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPLO60437 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPLO60437 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPLO60437 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPLO60437 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPLO60437 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PPLO60437 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPLO60437 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPLO60437 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPLO60437 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPLO60437 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms