Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX15O60248 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX15O60248 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX15O60248 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms