Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms