Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms