Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CRXO43186 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CRXO43186 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CRXO43186 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CRXO43186 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CRXO43186 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRXO43186 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRXO43186 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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