Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1CO15160 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1CO15160 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1CO15160 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms